W 1999 roku utworzone zostało 3 letnie gimnazjum. Naukę kończy egzamin sprawdzający kompetencje w zakresie przedmiotów humanistycznych i  matematyczno przyrodniczych. Helskie gimnazjum ma już bogatą tradycję - corocznie 2 października w dniu patrona szkoły odbywa się uroczystość przyjęcia uczniów Szkoły Podstawowej w poczet gimnazjalistów. Szkolnym uroczystościom towarzyszy hymn gimnazjum, którego autorką jest nasza polonistka pani Małgorzata Stachanowska. Uczniowie gimnazjum biorą udział w różnych uroczystościach szkolnych, miejskich, konkursach i zawodach oraz przedsięwzięciach na rzecz środowiska lokalnego.